آیت‌الله اعرافی با بیان اینکه کشتارهای پیاپی در مساجد افغانستان از حوادث دلخراش، زشت و قبیح است، تاکید کرد: مسئولیت این ناامنی‌ها با طالبان و کسانی که قدرت را در دست دارند است، در همین دوران کوتاه حکومت تان انواع مظالم و تعارض به نوامیس، مال و جان مردم را شاهد بودیم باید این را کنترل کنید.

آیت‌الله علیرضا اعرافی در بیانیه‌ای جنایت هولناک در مزار شریف افغانستان را محکوم کرد و گفت: عاملان و مسببان فاجعه افغانستان شناسایی و مجازات شوند‌.